More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0216 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0216  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
121 aa  243  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0293  50S ribosomal protein L14  71.07 
 
 
121 aa  167  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  150  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  148  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  147  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  144  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  143  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  58.2 
 
 
122 aa  142  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  141  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  140  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  140  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  140  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  139  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  58.2 
 
 
122 aa  139  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  137  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1236  50S ribosomal protein L14  56.2 
 
 
123 aa  137  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.438717  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  56.56 
 
 
122 aa  137  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  137  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  137  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  59.35 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  135  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000028271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  57.38 
 
 
122 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0499  50S ribosomal protein L14  54.92 
 
 
122 aa  135  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  59.02 
 
 
122 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  58.2 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  55.74 
 
 
122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>