More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1718 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  72.73 
 
 
132 aa  200  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  68.94 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  62.88 
 
 
132 aa  174  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  62.88 
 
 
132 aa  174  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  63.64 
 
 
132 aa  173  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  60.61 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  59.09 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  61.36 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  61.36 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  60.61 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  61.36 
 
 
132 aa  166  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 
132 aa  165  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  61.83 
 
 
132 aa  164  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  60.31 
 
 
132 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 
132 aa  156  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  60.31 
 
 
132 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  59.54 
 
 
132 aa  155  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
135 aa  150  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 
138 aa  138  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  49.23 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  49.23 
 
 
138 aa  134  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  46.92 
 
 
137 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  47.2 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  46.15 
 
 
140 aa  126  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  48.46 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  47.2 
 
 
140 aa  116  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  44.62 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  52.03 
 
 
144 aa  115  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  51.22 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  47.97 
 
 
144 aa  114  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  50.41 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  49.59 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  43.9 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  47.93 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  42.06 
 
 
122 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  43.65 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  43.65 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  43.8 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  84  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  84  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3713  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0701  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000715462  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  42.86 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  43.8 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2569  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  40.48 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>