More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0484 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  99.18 
 
 
122 aa  244  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  169  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  169  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  169  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  167  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  167  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  67.21 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  64.75 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  63.11 
 
 
122 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  67.21 
 
 
122 aa  161  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  160  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  64.75 
 
 
122 aa  160  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  160  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  159  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  159  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  60.66 
 
 
122 aa  159  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  158  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1236  50S ribosomal protein L14  64.46 
 
 
123 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.438717  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  157  5e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  157  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  156  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  156  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  156  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  156  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  156  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  63.93 
 
 
122 aa  156  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  156  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 
122 aa  156  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  60.66 
 
 
122 aa  155  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  59.84 
 
 
122 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  61.48 
 
 
122 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  59.84 
 
 
162 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>