More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1330 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
144 aa  287  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  79.86 
 
 
144 aa  234  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  79.17 
 
 
144 aa  233  9e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  78.47 
 
 
144 aa  231  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  78.47 
 
 
144 aa  229  9e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  66.67 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  56.92 
 
 
138 aa  158  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  56.92 
 
 
138 aa  156  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  54.76 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  54.26 
 
 
132 aa  137  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  49.24 
 
 
132 aa  134  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 
132 aa  133  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  53.85 
 
 
132 aa  131  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  56.14 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  45.38 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  48.46 
 
 
132 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  47.01 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  43.85 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  56.14 
 
 
132 aa  124  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  55.26 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  55.26 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  44.83 
 
 
140 aa  124  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.75 
 
 
140 aa  124  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  56.14 
 
 
132 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  43.85 
 
 
137 aa  122  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  46.09 
 
 
132 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 
132 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  47.97 
 
 
132 aa  120  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  47.79 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  42.34 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  44.35 
 
 
132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  40.94 
 
 
122 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  41.46 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89472  predicted protein  39.1 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  36.36 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  35.54 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  38.58 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  35.77 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  39.02 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  40.34 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  35.54 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  36.59 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  38.02 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  36.97 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0293  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  38.66 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  37.4 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  38.46 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  37.01 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  38.21 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  40.65 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  37.01 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17301  50S ribosomal protein L14  37.4 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.38809  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  39.84 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1119  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19931  50S ribosomal protein L14  36.59 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  34.65 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  39.5 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  36.22 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf432  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0671  50S ribosomal protein L14  36.29 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.608974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  37.4 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  38.58 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  34.96 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16681  50S ribosomal protein L14  35.77 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  36.97 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  36.97 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  36.97 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  36.22 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  36.51 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  36.51 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17391  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1640  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  32.28 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17551  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  34.65 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  36.59 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  34.96 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0805  50S ribosomal protein L14  37.01 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000675235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  41.46 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  41.46 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  38.66 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  32.23 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  38.58 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  41.46 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  35.54 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  39.5 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  37.4 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  38.46 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>