More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1725 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  95.9 
 
 		 122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 		 122 aa  231  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 		 122 aa  230  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 		 122 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 		 122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 		 122 aa  211  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 		 122 aa  211  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 		 122 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  210  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  210  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  210  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  209  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  85.25 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 		 122 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 		 122 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 		 122 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  205  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  205  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  81.3 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  86.55 
 
 		 119 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  85.71 
 
 		 119 aa  204  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  204  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  85.71 
 
 		 119 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  81.97 
 
 		 122 aa  202  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  197  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  197  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000783704  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0999  ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00274918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000101155  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000176442  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000995848  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000123635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278183  unclonable  0.0000000000139083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000238487  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000182968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000000971398  hitchhiker  0.0000000993182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000141408  unclonable  0.0000000000497407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  193  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2164  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000108066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000280121  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000168914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0436  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000433356  hitchhiker  0.0000995227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  79.67 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000146326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  72.95 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  190  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>