More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1151 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  77.05 
 
 		 122 aa  199  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23370  LSU ribosomal protein L14P  76.23 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000150198  hitchhiker  0.00000101977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  69.67 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  176  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2808  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  65.57 
 
 		 122 aa  173  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  174  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  68.85 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  63.93 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  173  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  62.3 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  69.11 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  64.75 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  68.07 
 
 		 119 aa  170  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  63.11 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  62.3 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  61.48 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  63.11 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  67.23 
 
 		 119 aa  169  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  67.23 
 
 		 119 aa  169  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  169  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  169  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>