More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23370  LSU ribosomal protein L14P  86.89 
 
 		 122 aa  202  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000150198  hitchhiker  0.00000101977 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  199  8e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2168  ribosomal protein L14  91.8 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.141545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  72.95 
 
 		 122 aa  183  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  70.49 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4534  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143523  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  66.39 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  175  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4307  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000141408  unclonable  0.0000000000497407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4680  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000132736  hitchhiker  0.0000717726 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  71.54 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  70.73 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000194944  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000168914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>