More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2323 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  208  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  204  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  201  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  192  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  191  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  190  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  189  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  189  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  189  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  188  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  72.13 
 
 
122 aa  187  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  185  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  72.13 
 
 
122 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  184  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  185  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  183  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  183  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  182  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  181  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3657  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 
122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 
122 aa  179  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  72.13 
 
 
122 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  179  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 
122 aa  179  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  68.03 
 
 
122 aa  178  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  66.39 
 
 
122 aa  178  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  176  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1054  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0459954  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1025  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1042  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  176  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000125925  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  176  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  176  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  176  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  176  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  176  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>