More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0301 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1473  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  210  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  209  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  207  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  204  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  204  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  203  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  81.97 
 
 
122 aa  202  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  197  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  193  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0605  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  192  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 
122 aa  190  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  189  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  189  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  188  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  187  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  185  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  183  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3657  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  179  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 
122 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  70.49 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  176  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  65.57 
 
 
122 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1564  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  175  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00163775  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  174  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 
122 aa  174  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  174  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  173  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  68.85 
 
 
122 aa  173  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  68.85 
 
 
122 aa  173  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  173  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  173  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  173  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  173  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  170  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  170  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  169  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  169  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  63.11 
 
 
122 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 
122 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  167  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  167  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl133  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  167  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  166  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  166  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
162 aa  166  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 
122 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>