More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1175 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  241  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  99.18 
 
 
122 aa  239  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  223  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  190  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  189  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  189  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  189  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  77.05 
 
 
122 aa  188  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  186  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  186  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  185  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  75.41 
 
 
122 aa  184  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  76.23 
 
 
122 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  184  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  184  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  183  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  183  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  73.77 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 
122 aa  180  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  179  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  179  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  179  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 
122 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  178  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1473  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  176  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  174  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10728  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  174  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.440716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  174  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0301  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  174  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0832822  unclonable  8.746580000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  174  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6604  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  173  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3657  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429118  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>