More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0670 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 		 122 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 		 122 aa  222  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 		 122 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  201  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  196  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  78.69 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000686211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1356  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0481946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  186  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  72.95 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101997  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  76.47 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000512994  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000413124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  75.41 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  73.98 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  74.79 
 
 		 119 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  74.79 
 
 		 119 aa  184  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>