More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0574 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  266  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  80.3 
 
 
132 aa  224  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  71.97 
 
 
132 aa  206  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  70.45 
 
 
132 aa  205  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  70.45 
 
 
132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 
132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  60.61 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  58.33 
 
 
132 aa  167  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 
132 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 
132 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  156  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  156  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  53.79 
 
 
132 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 
135 aa  147  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
132 aa  143  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  141  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
132 aa  140  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
132 aa  139  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  53.98 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  48.36 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  47.79 
 
 
141 aa  123  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  44 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  44.44 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  46.28 
 
 
138 aa  110  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.68 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  43.44 
 
 
137 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  44.35 
 
 
144 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  44.35 
 
 
144 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  43.48 
 
 
144 aa  104  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  43.48 
 
 
144 aa  104  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  42.61 
 
 
144 aa  103  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  36.15 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  42.4 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  44 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  44 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  44 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  44 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  43.2 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  43.2 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  42.15 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  42.61 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  40.83 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  42.4 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000810078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  41.53 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  42.02 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  43.75 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  44.83 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  42.4 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000171332  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0281  50S ribosomal protein L14  38.52 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000523315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  42.86 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000025532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  40.87 
 
 
122 aa  77  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0805  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000675235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  38.84 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  39.67 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>