More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0101 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
138 aa  278  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  78.26 
 
 
138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  59.38 
 
 
141 aa  164  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  60.18 
 
 
135 aa  153  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  56.92 
 
 
144 aa  147  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  55.38 
 
 
144 aa  144  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  54.62 
 
 
144 aa  142  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  54.62 
 
 
144 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  51.52 
 
 
132 aa  140  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  51.13 
 
 
132 aa  139  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  52.31 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  52 
 
 
132 aa  138  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  49.6 
 
 
132 aa  137  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  50.77 
 
 
132 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
132 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  48.09 
 
 
132 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  49.6 
 
 
132 aa  134  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  49.23 
 
 
132 aa  134  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  48.8 
 
 
132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  50.4 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  54.7 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  50 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  47.73 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  53.98 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  51.28 
 
 
138 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  46.15 
 
 
140 aa  120  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  47.86 
 
 
137 aa  120  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  49.57 
 
 
143 aa  120  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  49.56 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  47.5 
 
 
121 aa  98.2  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 
122 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  44.8 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  47.11 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf432  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3713  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  45.83 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  45.83 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  48.76 
 
 
122 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  94  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  42.15 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000201498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000364384  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000402045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3626  50S ribosomal protein L14  45.08 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000411381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000683604  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3797  50S ribosomal protein L14  45.08 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0333  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000092381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3812  50S ribosomal protein L14  45.08 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000039471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000579404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>