More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1838 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 
132 aa  266  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  90.15 
 
 
132 aa  249  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  90.15 
 
 
132 aa  246  7e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  90.15 
 
 
132 aa  246  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  89.39 
 
 
132 aa  245  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  61.36 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  161  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  54.55 
 
 
132 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 
132 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 
132 aa  156  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 
132 aa  156  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  53.44 
 
 
132 aa  152  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  55.65 
 
 
135 aa  149  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  53.44 
 
 
132 aa  148  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  52.67 
 
 
132 aa  147  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
132 aa  146  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  52.67 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  52.8 
 
 
138 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  49.6 
 
 
138 aa  137  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  49.22 
 
 
140 aa  133  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  49.22 
 
 
138 aa  129  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 
144 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  51.52 
 
 
144 aa  127  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  45.74 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 
144 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 
144 aa  124  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  49.24 
 
 
144 aa  123  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  44.53 
 
 
137 aa  121  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.75 
 
 
140 aa  120  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  44.7 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  47.83 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  45.76 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  47.93 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  44.8 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 
122 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  42.98 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  46.15 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  44.44 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  46.09 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0338  50S ribosomal protein L14  40.5 
 
 
160 aa  90.1  8e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.47925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  41.8 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000158675  hitchhiker  0.00000386502 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  41.32 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  45.45 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  46.09 
 
 
122 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  47.86 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2569  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  46.96 
 
 
122 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1119  50S ribosomal protein L14  40.8 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06350  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 
116 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0777  ribosomal protein L14  46.28 
 
 
122 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000394728  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0686  50S ribosomal protein L14  47.01 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  47.83 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 
122 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19931  50S ribosomal protein L14  40.8 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
122 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3741  50S ribosomal protein L14  42.62 
 
 
123 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000040815  hitchhiker  0.0036093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  44.35 
 
 
122 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  44.64 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  40 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  42.98 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000461836  hitchhiker  0.00000100945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>