More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0542 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  81.82 
 
 		 132 aa  231  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  83.33 
 
 		 132 aa  229  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  76.52 
 
 		 132 aa  219  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  71.97 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 		 132 aa  176  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  62.12 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  61.36 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  54.55 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  53.79 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  54.96 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  51.52 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  51.52 
 
 		 138 aa  140  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  50.38 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  46.21 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  50.44 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  45.9 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  47.83 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  45.3 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  42.28 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  44.44 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  47.01 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  42.98 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  43.44 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  40.74 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.48 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  49.57 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  43.8 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  47.01 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  43.22 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0711  50S ribosomal protein L14  47.01 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  40.68 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0499  50S ribosomal protein L14  42.15 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0204  LSU ribosomal protein L14P  40.5 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0722416  normal  0.193955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  42.62 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  43.59 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  43.7 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  43.7 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17391  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17551  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  41.8 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0366  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1640  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  47.01 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000964027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  0.0000000445572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  39.32 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  43.22 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  44.35 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  47.01 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  46.28 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  39.32 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23121  50S ribosomal protein L14  42.61 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  40.16 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  41.74 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16681  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  42.74 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19931  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1119  50S ribosomal protein L14  41.03 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  41.88 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  44.44 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>