More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1958 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1958  ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  243  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.709109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  229  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  229  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1767  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  228  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0094  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  216  7e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.840193  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0296  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  189  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  184  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  183  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  180  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0708  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  180  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000253605  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0676  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  180  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  180  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  179  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0857  50S ribosomal protein L14P  72.13 
 
 
122 aa  179  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045914  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  69.67 
 
 
162 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  177  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  68.03 
 
 
122 aa  176  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  176  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  176  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  176  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  176  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  175  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  0.0000027231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000379152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000172755  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000305715  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  175  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2764  ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000816669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  175  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  175  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 
122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  66.39 
 
 
122 aa  174  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  71.9 
 
 
119 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  69.67 
 
 
122 aa  174  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 
122 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>