More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2439 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  90.15 
 
 		 132 aa  246  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  87.88 
 
 		 132 aa  243  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  88.64 
 
 		 132 aa  241  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  87.88 
 
 		 132 aa  240  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  63.64 
 
 		 132 aa  173  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  59.85 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  56.06 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  57.58 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  56.82 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  53.44 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  53.44 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  54.84 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  52.67 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  51.91 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  52.67 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  52.8 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  50.4 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  47.69 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  48.44 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  48.44 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  51.15 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  44.96 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  50.76 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  46.97 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  49.62 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  48.85 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.75 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  43.75 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  46.96 
 
 		 122 aa  93.2  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  48.72 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1846  ribosomal protein L14  44.63 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.655249999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1128  50S ribosomal protein L14  45.76 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0430219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  45.22 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  45.22 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  47.01 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  44.26 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  44.8 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19931  50S ribosomal protein L14  42.4 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  46.15 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1119  50S ribosomal protein L14  42.4 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  49.57 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111281  hitchhiker  0.00000195891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  44.35 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  48.72 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0236  50S ribosomal protein L14  46.96 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  44 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  44.35 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0044  50S ribosomal protein L14  46.09 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.28524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  44.63 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0780  ribosomal protein L14  46.61 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1694  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00501261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1865  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2569  50S ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2071  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0845343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  47.01 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1965  50S ribosomal protein L14  40.8 
 
 		 121 aa  87.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.555116  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  47.86 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  45.3 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  41.88 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  49.52 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  43.59 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  43.7 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  44.64 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1023  50S ribosomal protein L14  46.09 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000448191  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0069  50S ribosomal protein L14  43.97 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  45.45 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>