More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1157 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  95.08 
 
 		 122 aa  235  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  91.8 
 
 		 122 aa  227  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  82.79 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  79.51 
 
 		 122 aa  196  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  77.05 
 
 		 122 aa  193  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  76.23 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  191  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 121 aa  190  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  187  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 		 122 aa  187  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  74.59 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  72.13 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09900  LSU ribosomal protein L14P  69.67 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0142429  hitchhiker  0.00000177092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  176  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 		 122 aa  175  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000708463  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000265489  decreased coverage  0.00000000000145163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5134  ribosomal protein L14  73.77 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000945972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000898489  unclonable  0.00000000000302699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000545042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>