More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3895 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  239  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  95.9 
 
 
122 aa  234  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  95.08 
 
 
122 aa  231  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  230  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  229  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  230  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  94.26 
 
 
122 aa  227  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  93.44 
 
 
122 aa  226  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  226  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  226  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  91.8 
 
 
122 aa  226  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  226  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  91.8 
 
 
122 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  90.16 
 
 
122 aa  224  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  91.8 
 
 
122 aa  223  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  90.16 
 
 
122 aa  223  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  222  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  90.16 
 
 
122 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  87.7 
 
 
122 aa  220  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  90.16 
 
 
122 aa  219  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  216  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  214  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10728  50S ribosomal protein L14  93.44 
 
 
122 aa  206  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.440716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1133  ribosomal protein L14  90.98 
 
 
122 aa  204  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6604  ribosomal protein L14  91.8 
 
 
122 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1054  50S ribosomal protein L14  90.98 
 
 
122 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0459954  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1025  50S ribosomal protein L14  90.98 
 
 
122 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1042  50S ribosomal protein L14  90.98 
 
 
122 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000125925  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4497  ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  201  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1195  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  200  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5134  ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0768  50S ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  194  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000575392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  77.87 
 
 
122 aa  190  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  190  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2450  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.313551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  187  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2392  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  187  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000369599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  74.59 
 
 
122 aa  187  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0605  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  187  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  186  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1717  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  186  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  186  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  76.23 
 
 
122 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3014  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0637161  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2701  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  185  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0235  50S ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2913  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  184  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2704  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2389  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  184  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3657  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  183  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  72.13 
 
 
122 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  75.41 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  72.95 
 
 
122 aa  181  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  73.77 
 
 
122 aa  181  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 
122 aa  180  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 
122 aa  180  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>