More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1175 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0976  ABC transporter related  69.35 
 
 
463 aa  684    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.684881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1045  ABC transporter related  71.58 
 
 
463 aa  659    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1175  ABC transporter related  100 
 
 
469 aa  936    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.902135  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1315  ABC transporter related  72.61 
 
 
463 aa  665    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.101862  normal  0.379363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
502 aa  324  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.06 
 
 
513 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.38 
 
 
510 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
510 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
510 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
534 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 
510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  40.59 
 
 
504 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
501 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
510 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  38.1 
 
 
510 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  37.76 
 
 
510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  38.97 
 
 
505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1645  ABC transporter related  42.68 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.467673  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 
523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  37.89 
 
 
510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.56 
 
 
498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.43 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  37.24 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  36.76 
 
 
509 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  36.86 
 
 
509 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  36.08 
 
 
507 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  38.22 
 
 
503 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  38.99 
 
 
547 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
508 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0475  ABC transporter related  40.95 
 
 
479 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000128955  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  39.96 
 
 
551 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
545 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  40.54 
 
 
512 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  37.53 
 
 
507 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  38.45 
 
 
506 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  39.2 
 
 
524 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
511 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.92 
 
 
528 aa  296  7e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  40.08 
 
 
517 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
511 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  37.7 
 
 
525 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  35.27 
 
 
509 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  37.14 
 
 
528 aa  293  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  37.99 
 
 
524 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1591  ABC transporter related  41.51 
 
 
478 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.243746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
505 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 
522 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  38.32 
 
 
507 aa  290  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  38.32 
 
 
507 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  38 
 
 
537 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1843  ABC transporter related  40.52 
 
 
477 aa  289  7e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.468577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  38.2 
 
 
527 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 
534 aa  287  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  39.38 
 
 
518 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  35.42 
 
 
510 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  40.46 
 
 
532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  37.47 
 
 
506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  36.27 
 
 
509 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  40.3 
 
 
527 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
511 aa  286  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  37.76 
 
 
527 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  36.25 
 
 
521 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  34.98 
 
 
511 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5248  ABC transporter related  36.29 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  35.66 
 
 
514 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.53 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  38.51 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  35.05 
 
 
511 aa  282  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.87 
 
 
499 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1510  ATPase  37.03 
 
 
513 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4348  ABC transporter related  37.97 
 
 
499 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  36.18 
 
 
509 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  35.67 
 
 
551 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.43 
 
 
509 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  35.82 
 
 
500 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.12 
 
 
501 aa  280  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  37.34 
 
 
604 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  36.74 
 
 
491 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  36.83 
 
 
533 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  35.61 
 
 
520 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
506 aa  277  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.12 
 
 
512 aa  277  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
516 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
532 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  36.76 
 
 
495 aa  275  9e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  36.67 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.28 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  33.95 
 
 
518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0212  ABC transporter related  36.58 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1924  ABC transporter related  37.58 
 
 
524 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0164399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
522 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  37.92 
 
 
494 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  37.6 
 
 
511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  38.46 
 
 
558 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>