280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2020 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2020  glycogen synthase  100 
 
 		 491 aa  1018    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0349477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2246  glycogen synthase  65.7 
 
 		 491 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0330  glycogen synthase  60 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2377  glycogen synthase  59.79 
 
 		 489 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.698809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2189  glycogen synthase  58.14 
 
 		 489 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1808  glycogen synthase  54.19 
 
 		 489 aa  567  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0220  glycogen synthase  53.37 
 
 		 489 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  31.33 
 
 		 484 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.73 
 
 		 480 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.87 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.87 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  31.7 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.88 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  32.12 
 
 		 480 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  31.54 
 
 		 476 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.65 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.34 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.14 
 
 		 496 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.47 
 
 		 488 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  31.78 
 
 		 480 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.51 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  32.12 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.16 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  31.72 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  31.92 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  30.99 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  31.92 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  31.92 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.11 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.32 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  31.76 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  31.36 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.57 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  31.52 
 
 		 498 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  30.67 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.56 
 
 		 490 aa  249  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  30.37 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  32.99 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.1 
 
 		 497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.98 
 
 		 487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.54 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.63 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  29.82 
 
 		 506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.12 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.55 
 
 		 475 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.27 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.1 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  28.46 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.44 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.36 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  31.3 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.24 
 
 		 483 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.91 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.75 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  29.36 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  31.25 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.49 
 
 		 503 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.23 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  29.81 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.1 
 
 		 494 aa  226  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.15 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  29.23 
 
 		 489 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.36 
 
 		 491 aa  223  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.01 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.45 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.61 
 
 		 496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.66 
 
 		 491 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.48 
 
 		 491 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  29.86 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.88 
 
 		 490 aa  219  7e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  29.94 
 
 		 493 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.51 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.42 
 
 		 534 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.87 
 
 		 493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.59 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.6 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.24 
 
 		 489 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  30.24 
 
 		 482 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.98 
 
 		 481 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  28.95 
 
 		 477 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.17 
 
 		 494 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  28.95 
 
 		 477 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  28.37 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  28.26 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  28.07 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  27.31 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.63 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.4 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.82 
 
 		 499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  29.47 
 
 		 491 aa  213  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.98 
 
 		 498 aa  213  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  28.54 
 
 		 486 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  28.57 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  28.43 
 
 		 486 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.86 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.44 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.19 
 
 		 485 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  28.11 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  29.38 
 
 		 482 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>