93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1251 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  100 
 
 
134 aa  279  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  72.39 
 
 
181 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  72.18 
 
 
135 aa  206  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  71.21 
 
 
135 aa  204  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  75.4 
 
 
135 aa  202  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  70.45 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  70.99 
 
 
133 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  54.2 
 
 
134 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  54.96 
 
 
134 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  54.2 
 
 
135 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  54.2 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  53.44 
 
 
134 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  45.38 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  49.53 
 
 
159 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  41.03 
 
 
735 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  38.94 
 
 
732 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  36.75 
 
 
742 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  36.75 
 
 
742 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  36.75 
 
 
742 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  37.61 
 
 
728 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  36.75 
 
 
729 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  36.75 
 
 
728 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  36.75 
 
 
729 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  36.75 
 
 
729 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  36.75 
 
 
729 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  37.61 
 
 
728 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  37.39 
 
 
728 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  36.75 
 
 
728 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  37.39 
 
 
728 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  38.94 
 
 
728 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  38.94 
 
 
728 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  36.75 
 
 
728 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  37.39 
 
 
728 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  38.94 
 
 
731 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  36.52 
 
 
734 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  36.75 
 
 
728 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  35.9 
 
 
728 aa  90.5  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  37.39 
 
 
728 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  35.65 
 
 
734 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  35.04 
 
 
728 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  35.9 
 
 
727 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  36.52 
 
 
734 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  36.52 
 
 
734 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  36.52 
 
 
734 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  27.97 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  27.87 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  25.64 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.3 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  25.45 
 
 
248 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  26.26 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  29.73 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  23.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  25.21 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  21.88 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  23.14 
 
 
134 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  28.83 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  24.24 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  31.37 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  24.82 
 
 
410 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  29.07 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  26.4 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  28.26 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  28.26 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  28.26 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  24.09 
 
 
410 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.35 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  25.98 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.26 
 
 
130 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  29.03 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  30.11 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  26.32 
 
 
415 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  30.97 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  27.08 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  23.3 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  31.03 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  35.94 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  28.43 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  27.27 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  26.14 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.26 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  28.67 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  31.58 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  25 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  26.76 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  26.74 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2279  OsmC family protein  20.2 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0377998  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  25 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.33 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1595  OsmC family protein  20.65 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  24.42 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>