46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3682 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  31.48 
 
 		 727 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  34.26 
 
 		 734 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  30.28 
 
 		 742 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 732 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  32.35 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  30.28 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  30.28 
 
 		 742 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  30.28 
 
 		 742 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  34.26 
 
 		 734 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  30.28 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  30.28 
 
 		 729 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  30.28 
 
 		 728 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  30.28 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  30.28 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  30.28 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  32.41 
 
 		 734 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  30.28 
 
 		 728 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  33.33 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 731 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  30.56 
 
 		 728 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  32.41 
 
 		 734 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  30.56 
 
 		 728 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  30.56 
 
 		 728 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  33.02 
 
 		 728 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  32 
 
 		 728 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  29.36 
 
 		 728 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  30.56 
 
 		 734 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  29.36 
 
 		 728 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 735 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  30.39 
 
 		 728 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  28.44 
 
 		 728 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  27.88 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  32 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  29.55 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  25.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  24.47 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  27.96 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  27.27 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  29.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  26.6 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  28.42 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  26.37 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  26.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  30 
 
 		 138 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  24.18 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>