96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04005 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  78.72 
 
 		 238 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  69.62 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0183  hypothetical protein  69.62 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  34.42 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  39.81 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  34.36 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.67 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  20.93 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0438  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.88 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  20.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.38 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.04 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 819 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.62 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  25.32 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  22.98 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  34.62 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  27.43 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4170  HAD family hydrolase  35.25 
 
 		 787 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243579  normal  0.356217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1316  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  23.33 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  28.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.16 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4644  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.17 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.35 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  26.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.09 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.59 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  23.95 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0614  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.24 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.21 
 
 		 493 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 799 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2544  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.83 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00145664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2640  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.83 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.87 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  34.88 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  28.29 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  28.3 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  26.58 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  28.3 
 
 		 217 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  34.97 
 
 		 305 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.32 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  31.06 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.11 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  26.41 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 750 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  23.75 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2774  hypothetical protein  30.57 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  25.94 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  29.71 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.21 
 
 		 306 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0481  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.61 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  23.71 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  23.74 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0490  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6363  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  32.06 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.499829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0054  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.8 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.25 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3055  hypothetical protein  25.78 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.47 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  26.32 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.87 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26514  predicted protein  22.27 
 
 		 262 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0100496  normal  0.0236046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.66 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>