More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0614 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0614  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  61.37 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  60.53 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.65 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  58.41 
 
 		 286 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4355  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  59.31 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  57.64 
 
 		 289 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.8 
 
 		 306 aa  255  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02790  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  57.38 
 
 		 323 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6135  HAD family hydrolase  56.47 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6738  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  56.07 
 
 		 294 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  58.8 
 
 		 288 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0481  HAD family hydrolase  57.52 
 
 		 295 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0490  HAD family hydrolase  55.79 
 
 		 297 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  54.19 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3299  HAD family hydrolase  53.47 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  54.39 
 
 		 352 aa  245  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  52.67 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0843  HAD family hydrolase  56.05 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163877  normal  0.772835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  55.56 
 
 		 295 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  51.3 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0438  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  50.2 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  53.63 
 
 		 290 aa  235  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  52.89 
 
 		 312 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  53.36 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  53.36 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  53.36 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8329  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  55.61 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  52.89 
 
 		 373 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  48.22 
 
 		 311 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3259  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  51.77 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  37.89 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  38.33 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.84 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  38.33 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  38.33 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  39.11 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4644  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.28 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.96 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  34.75 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.82 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  38.99 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.59 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0054  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.02 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6363  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  36.28 
 
 		 272 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.499829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.21 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2761  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.86 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.15107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.05 
 
 		 493 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0515  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.22 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.589704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  34.72 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.16 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.5 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 518 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  30.18 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.41 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3624  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.66 
 
 		 561 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3692  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.66 
 
 		 561 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.000184882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3619  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.66 
 
 		 561 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00474083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  32.88 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  31.22 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  31.98 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.36 
 
 		 488 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.63 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.72 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.18 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 217 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  29.72 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 218 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 217 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  31.08 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 221 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  29.25 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0886  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  31.08 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12504  bifunctionnal transmembrane phospholipid biosynthesis enzyme plsC: L-3-phosphoserine phosphatase + 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 		 580 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.088131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 217 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.11 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  33.19 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>