64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0183 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0183  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  98.33 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  69.62 
 
 		 238 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  67.93 
 
 		 238 aa  324  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  35.16 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  32.09 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  21.53 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.19 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  28.78 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2640  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.16 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2544  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.16 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00145664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1316  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  21.15 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  24.52 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.25 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.82 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  28.05 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.73 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.27 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.55 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  27.75 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.63 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  27 
 
 		 799 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0614  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.85 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.73 
 
 		 284 aa  45.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.75 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  27.35 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  26.2 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  26.57 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.32 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  26.64 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  25.24 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 750 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.68 
 
 		 493 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.58 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.58 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  25.76 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  30.97 
 
 		 287 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  31.62 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>