76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0161 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0183  hypothetical protein  98.33 
 
 
240 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  69.62 
 
 
238 aa  332  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  67.51 
 
 
238 aa  322  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  32.86 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  35.45 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.71 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  22.27 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  20.54 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
235 aa  52  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2544  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.67 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00145664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.71 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2640  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.67 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1316  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  33.58 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.82 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  28.17 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  26.51 
 
 
241 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.73 
 
 
196 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  26.64 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.25 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  25.47 
 
 
247 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
220 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  27.75 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  26.2 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.55 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  26.92 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.75 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  26.89 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.73 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  23.22 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  30.97 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  32.5 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  30.3 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  27.48 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
799 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.32 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.75 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0614  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.33 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  27.75 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  31.62 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.51 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
750 aa  42.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.51 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.12 
 
 
493 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
307 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  30.97 
 
 
287 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.54 
 
 
275 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
220 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
220 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
290 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>