More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4843 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
302 aa  614  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  81 
 
 
300 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  56.3 
 
 
292 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.96 
 
 
322 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.63 
 
 
301 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.63 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.89 
 
 
360 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.77 
 
 
301 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  42.25 
 
 
306 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.2 
 
 
300 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  44.1 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  44.1 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  44.1 
 
 
292 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.48 
 
 
290 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  43.75 
 
 
315 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  44.1 
 
 
412 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  43.75 
 
 
315 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.55 
 
 
288 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.36 
 
 
319 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  46.5 
 
 
333 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  48.1 
 
 
309 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  42 
 
 
314 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  39.39 
 
 
297 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  45.64 
 
 
406 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.01 
 
 
336 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.46 
 
 
278 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.93 
 
 
294 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  36.5 
 
 
286 aa  176  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.51 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  42.37 
 
 
274 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  36.58 
 
 
316 aa  165  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.02 
 
 
308 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.8 
 
 
316 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.74 
 
 
311 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.27 
 
 
277 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.21 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  38.71 
 
 
285 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.44 
 
 
275 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  39.07 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.67 
 
 
276 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1411  Esterase/lipase  35.65 
 
 
245 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.667449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  34.36 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  37.06 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  42.19 
 
 
314 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  32.31 
 
 
420 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  35.42 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.77 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  30.33 
 
 
291 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.51 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  30.51 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  31.7 
 
 
431 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  37.59 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  36.55 
 
 
282 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  35.33 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  29.09 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.03 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  37.93 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  30.77 
 
 
403 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  29.13 
 
 
644 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  29.69 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0293  esterase/lipase  35.05 
 
 
381 aa  85.9  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.7 
 
 
407 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
407 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.13 
 
 
321 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  34 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.43 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.87 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  31.14 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  31.05 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  28.41 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  32.05 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  31.43 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  26.44 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.63 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  30.41 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  33.76 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  26.44 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  24.68 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  31.67 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.03 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  29.28 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  30.1 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  35.77 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29.28 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29.28 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  35.17 
 
 
589 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  31.07 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  36 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.35 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  44.35 
 
 
309 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  27.24 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  27.24 
 
 
593 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.33 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  26.22 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  27.35 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.34 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>