71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0038 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  100 
 
 		 696 aa  1435    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  41.6 
 
 		 656 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.01 
 
 		 631 aa  346  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.68 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  30.7 
 
 		 669 aa  283  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  27.84 
 
 		 621 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  28.82 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  27.72 
 
 		 785 aa  217  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  26.5 
 
 		 695 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.89 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  24.32 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  28.11 
 
 		 842 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  28.09 
 
 		 609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  26.17 
 
 		 722 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  24.21 
 
 		 689 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.78 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  24.85 
 
 		 697 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  25 
 
 		 697 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  22.9 
 
 		 695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  25.75 
 
 		 656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.06 
 
 		 699 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  23.89 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  24.56 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.42 
 
 		 656 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  22.47 
 
 		 690 aa  98.6  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  24.71 
 
 		 704 aa  97.8  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  23.44 
 
 		 692 aa  95.1  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  22.14 
 
 		 561 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.76 
 
 		 699 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.4 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  24.58 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.7 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  22.51 
 
 		 569 aa  67  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  36.11 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  25.12 
 
 		 590 aa  57  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  35.29 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  22.81 
 
 		 571 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.93 
 
 		 555 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  21.02 
 
 		 573 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  35.71 
 
 		 593 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  20.85 
 
 		 552 aa  54.3  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  22.97 
 
 		 529 aa  53.9  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  35.29 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  31.19 
 
 		 582 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  22.92 
 
 		 663 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  35.29 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 680 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  28.16 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  28.16 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  29.36 
 
 		 664 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  21.25 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  35.71 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  32.74 
 
 		 559 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  30.25 
 
 		 223 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  22.71 
 
 		 574 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  21.39 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  21.39 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  29.73 
 
 		 600 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  32.2 
 
 		 619 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  31.19 
 
 		 568 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  35.96 
 
 		 573 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  29.46 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  27.54 
 
 		 723 aa  47.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  33.67 
 
 		 593 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  27.45 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  34.41 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  25.45 
 
 		 585 aa  45.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  29.13 
 
 		 451 aa  44.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.58 
 
 		 596 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  27.42 
 
 		 689 aa  43.9  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>