40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5241 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  85.48 
 
 		 187 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  77.05 
 
 		 187 aa  293  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  71.11 
 
 		 185 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  72.38 
 
 		 185 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  67.96 
 
 		 198 aa  257  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  58.38 
 
 		 196 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  57.69 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  57.65 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  56.5 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  50.6 
 
 		 188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  43.92 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  31.38 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 180 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  36.11 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
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NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  19.88 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 195 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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