189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1310 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  99.05 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0917  hypothetical protein  93.36 
 
 		 214 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4539  hypothetical protein  95.73 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4700  hypothetical protein  75.12 
 
 		 209 aa  332  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00659716  normal  0.0518536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  71.56 
 
 		 211 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  71.29 
 
 		 209 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  73.21 
 
 		 210 aa  288  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13000  hypothetical protein  67.14 
 
 		 210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5012  hypothetical protein  67.3 
 
 		 209 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57680  hypothetical protein  68.72 
 
 		 209 aa  270  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0203  hypothetical protein  43.56 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1407  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.27 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1194  hypothetical protein  42.57 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1102  hypothetical protein  42.08 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03823  hypothetical protein  41.5 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  37.93 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  39.69 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1962  hypothetical protein  37.07 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0236  alpha/beta hydrolase  37.07 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0497  hypothetical protein  41.1 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0124611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0310  hypothetical protein  41.43 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.910539  decreased coverage  0.00111956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  38.54 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  40.87 
 
 		 242 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  40.87 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0211  hypothetical protein  37.96 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4219  hypothetical protein  40.76 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.399135 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  37.63 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4236  hypothetical protein  41.58 
 
 		 205 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.258628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  41.43 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2806  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.91 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.677247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0409  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.91 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.757883  normal  0.0151787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2944  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.45 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6237  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  38.99 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2904  alpha/beta fold family hydrolase  38.99 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0376  putative transmembrane protein  38.97 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.320901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2280  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.52 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2895  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.52 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2587  hypothetical protein  36.76 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0977  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.09 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  37.86 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4922  putative transmembrane protein  40.1 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0437  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.76 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  38.14 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0456  hypothetical protein  38.57 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3842  hypothetical protein  42.13 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4159  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0379  hypothetical protein  38.39 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  37.67 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0618  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.1 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0196  putative transmembrane protein  40 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0379578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0060  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0452  hypothetical protein  34.12 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  39.41 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0226  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1367  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3195  hypothetical protein  38.1 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0328  hypothetical protein  38.16 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  38.16 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0271  putative transmembrane protein  38.86 
 
 		 219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  hitchhiker  0.00000187884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0384  putative transmembrane protein  38.94 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5218  alpha/beta family hydrolase  36.89 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1042  hypothetical protein  35 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0266  putative transmembrane protein  38.3 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00224255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0050  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.55 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000985448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1964  alpha/beta fold family hydrolase  33.76 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  34.34 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  33.66 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3983  hypothetical protein  42.13 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  33.66 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3905  hypothetical protein  42.13 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1671  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.48 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1768  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  38.6 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0249  putative transmembrane protein  39.05 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00045708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  32.56 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0412  hypothetical protein  31.55 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  32.56 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  31.6 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1690  alpha/beta hydrolase family protein  35.65 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0627  hypothetical protein  31.07 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803242  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  31.68 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0331  putative transmembrane protein  36.67 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  31.63 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2391  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.86 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3190  alpha/beta hydrolase family protein  36.07 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5111  hypothetical protein  35.32 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.001249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  35.68 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  32.68 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3955  hypothetical protein  38.73 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5850  hypothetical protein  34.83 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0618  hypothetical protein  33.53 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.191604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  33.5 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0692  hypothetical protein  33.66 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627981  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0793  hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.0734113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  31.94 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  32.51 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  31.4 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>