105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1668 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  83.97 
 
 
369 aa  645    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  85.75 
 
 
372 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  73.92 
 
 
372 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  51.51 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  51.23 
 
 
379 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  52.04 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  47.98 
 
 
380 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  49.05 
 
 
380 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  49.59 
 
 
386 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  46.3 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  45.25 
 
 
379 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  44.02 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  46.03 
 
 
380 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  45.75 
 
 
380 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  43.13 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  44.41 
 
 
382 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  44.14 
 
 
383 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.76 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.74 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.61 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.28 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  23.85 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.98 
 
 
388 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.75 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  21.67 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.56 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  23.95 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.67 
 
 
374 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  20.35 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  23.41 
 
 
382 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  20.63 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  21.84 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  21.23 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  23.14 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  23.43 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  24.23 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  20 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  22.05 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.02 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.62 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  21.97 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  21.97 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.48 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  21.02 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.05 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.36 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.94 
 
 
379 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  21.29 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  21.36 
 
 
861 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  21.64 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  25.71 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  22.83 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  22.17 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.06 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.24 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  20.26 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  25.14 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0001  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0059  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0069  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  21.2 
 
 
370 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0087  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  0.765551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0068  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.35 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3250  carboxylate-amine ligase  22.99 
 
 
371 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3336  carboxylate-amine ligase  19.68 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.992435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  19.76 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.06 
 
 
381 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3298  carboxylate-amine ligase  20.91 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3064  carboxylate-amine ligase  22.54 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  0.504071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2917  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0214  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3394  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1626  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0001  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0001  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2975  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0069  carboxylate-amine ligase  21.79 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0001  carboxylate-amine ligase  22.14 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  22.69 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4113  hypothetical protein  21.05 
 
 
387 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  22.69 
 
 
371 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  18.81 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4332  glutamate--cysteine ligase GCS2  18.45 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2508  carboxylate-amine ligase  22.36 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  21.05 
 
 
865 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0490  carboxylate-amine ligase  18.18 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  19.47 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2729  glutamate--cysteine ligase GCS2  19.74 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.884579  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3493  carboxylate-amine ligase  19.44 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  21.7 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  21.23 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1548  carboxylate-amine ligase  19.11 
 
 
371 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  20.24 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4653  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.44 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.741083  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  20.44 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  17.78 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  21.74 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.41 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>