172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83628 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83628  hydrolase  100 
 
 		 455 aa  949    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  31.17 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  29.43 
 
 		 474 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  35.64 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 319 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 317 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 293 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  33.17 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  36.47 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 305 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  31.55 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  28.34 
 
 		 314 aa  100  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 327 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 289 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  32.4 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 303 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 301 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 323 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  33.5 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  29.67 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 307 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 297 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  31.51 
 
 		 332 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30208  predicted protein  29.36 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 315 aa  90.5  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  31.46 
 
 		 308 aa  89.7  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  30.9 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  30.14 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 301 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 261 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  29.3 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  30.77 
 
 		 175 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 271 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  32.66 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  33.54 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  24.4 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  32.23 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  28.5 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  26.34 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  32 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  26.81 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  37.7 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  34.1 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  30.85 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  31.38 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  26.05 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  26.86 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  30.05 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  27.23 
 
 		 303 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  29.38 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  25.11 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  29.74 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  25.75 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  30.85 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  26.01 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  26.01 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  26.01 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  25.45 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  29.7 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  32.53 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  30.81 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  27.91 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  25.48 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>