More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60011 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60011  predicted protein  100 
 
 		 131 aa  269  8.000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.49204  normal  0.483859 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07701  37S ribosomal protein S16 (AFU_orthologue; AFUA_5G08350)  56.99 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.741013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  45.92 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01360  mitochondrial ribosomal protein s24, putative  36.89 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  43.62 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  42.55 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  41.49 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  39.33 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  40.43 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  38.71 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  43.48 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  39 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02498  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0245657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  40 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  40 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  40.91 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2872  SSU ribosomal protein S16P  40.22 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  37.74 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2998  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00134476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  40.45 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  42.53 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  44.32 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  39.56 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  42.22 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  44.94 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  44.94 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  35.14 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  41.86 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  40.66 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2892  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  0.381108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2890  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  40 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2821  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3004  30S ribosomal protein S16  41.38 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0878334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  38.39 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  43.18 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  39.78 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  40.66 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  33.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  35.96 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  43.18 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  38.89 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  34.83 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  40.66 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  40 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  39.33 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  43.18 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  44.05 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  36.67 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  39.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  39.33 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  43.18 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  40.91 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  37.36 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  38.3 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  39.77 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  37.63 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  38.71 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  39.77 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  38.46 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  36.89 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  42.05 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  36.96 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  38.71 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  37.08 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  40.91 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  37.63 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  38.46 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  38.64 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  38.38 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  40.91 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  37.78 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  37.08 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0123  ribosomal protein S16  41.46 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.622663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  42.05 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  35.96 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  38.64 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  37.78 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  42.35 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  38.2 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  39.77 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  33.71 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  38.2 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>