180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54699 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  100 
 
 		 357 aa  739    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.98 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.03 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  30.2 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  26.65 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  29.12 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 		 343 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  27.25 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 303 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 		 303 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.97 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 303 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  27.59 
 
 		 311 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  26.88 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  26.47 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  25.22 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  21.53 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  27.2 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  22.49 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  28.24 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  28.63 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  28.36 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  27.78 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  24.16 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  26.05 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  27.84 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  28.51 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  27.37 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  26.51 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  25.29 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  27.64 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  23.55 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  28.46 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  24.93 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  21.89 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  24.62 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  27.07 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  24.32 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  25.37 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  26.09 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  25.1 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  24.71 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  24.02 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  24.71 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  25.44 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  27.17 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  22.46 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  22.92 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  22.7 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  22.69 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  23.1 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  23.3 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  23.3 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  22.87 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  22.39 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  24.13 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  22.81 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02330  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  23.01 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.64 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  22.73 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  24.22 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  27.68 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  21.18 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  23.05 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  24.9 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  24.2 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>