More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42420 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  100 
 
 		 368 aa  754    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  65.76 
 
 		 367 aa  504  9.999999999999999e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  55.38 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  51.72 
 
 		 410 aa  388  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  54.05 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  52.97 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  52.78 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  47.84 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  48.51 
 
 		 367 aa  345  5e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  48.23 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  43.09 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  42.59 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  43.58 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  41.19 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  42.93 
 
 		 369 aa  299  6e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  42.37 
 
 		 369 aa  295  7e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  42.36 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  41.24 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  41.24 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  42.16 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.75 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  42.27 
 
 		 370 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  41.78 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  39.89 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  39.47 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  41.6 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  38.46 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  36.1 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  39.63 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  36.7 
 
 		 371 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.34 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.07 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  28.27 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.05 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  27.35 
 
 		 377 aa  117  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.2 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.88 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  27.4 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  24.32 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  32.96 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.46 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  43.27 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  40.35 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  39.84 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  40.5 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  39.84 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  35.53 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.16 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.72 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  36.31 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  36.97 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  35.21 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  36.97 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  36.76 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  36.97 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  42.55 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  39.77 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  35.29 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  37.4 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  38.84 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.9 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  44.32 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  36.63 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  38 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.18 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  37.41 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  36.36 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  38.61 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.4 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  33.05 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  30.39 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  35.51 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.62 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  37 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  37.19 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  35.25 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  43.02 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  47.67 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  42.31 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  31.51 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  37.19 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.19 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  31.45 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  45.35 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  36.61 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  35.64 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  35.24 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  36.89 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  35.24 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  37.74 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.88 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  37.12 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  35.24 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  33.61 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  37.19 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.37 
 
 		 463 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.25 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  39.45 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>