197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33225 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  100 
 
 		 560 aa  1140    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  47.21 
 
 		 576 aa  491  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00180  SD08430p, putative  42.61 
 
 		 587 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.026528  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13668  MFS family transporter: acetyl-CoA  31.8 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00275578  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54049  acetyl-coa transporter  31.6 
 
 		 646 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 424 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 504 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 414 aa  87.4  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 465 aa  87  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.91 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  31.58 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  32.75 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  29.19 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.19 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.19 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  29.19 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  33.89 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  30.29 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  30.29 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  28.66 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  26 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 457 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  31.21 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  33.59 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  27.75 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.54 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  31.82 
 
 		 550 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  29.66 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.28 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  30.07 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  34.93 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  31.34 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  33.79 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  26.24 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  25.67 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  28.32 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  29.34 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.48 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  30.95 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  24.45 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  26.34 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  26.34 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 411 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  27.17 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>