57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28836 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  100 
 
 		 455 aa  929    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  29.6 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  25.9 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  27.87 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  26.12 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  25.83 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  23.1 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  27.48 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  24.24 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  26.97 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  24.42 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  23.61 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.69 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 676 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 676 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 676 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 807 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 674 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  25.32 
 
 		 601 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 752 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  28.48 
 
 		 758 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  26.39 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  25.53 
 
 		 671 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 763 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  30.4 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.75 
 
 		 804 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  26.32 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.15 
 
 		 571 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 912 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  25 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  48.65 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  25 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  25.11 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.62 
 
 		 540 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.27 
 
 		 771 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  35.62 
 
 		 1114 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  24.64 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  24.64 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  25 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.13 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  25 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 646 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 678 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  25.58 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 1148 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.77 
 
 		 558 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 628 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>