42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33116 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  100 
 
 
1057 aa  2195    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  24.41 
 
 
591 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44978  predicted protein  25.26 
 
 
532 aa  119  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.800208 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31966  predicted protein  23.86 
 
 
536 aa  104  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88213  predicted protein  23.53 
 
 
624 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753376  normal  0.742387 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04019  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03730)  24.2 
 
 
530 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.838735 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78175  predicted protein  23.97 
 
 
584 aa  94.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.586636 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06623  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03860)  24.4 
 
 
576 aa  93.6  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.81501  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32666  MFS family transporter  23.13 
 
 
508 aa  89  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.587753 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  25 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  39.01 
 
 
209 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  34.97 
 
 
273 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  35.88 
 
 
270 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10221  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08740)  27.85 
 
 
631 aa  78.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.51459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  29.36 
 
 
1444 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  35.92 
 
 
285 aa  75.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  33.59 
 
 
221 aa  76.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01423  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04150)  23.62 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.038724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  31.47 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  27.9 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  31.08 
 
 
274 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  32.14 
 
 
297 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  30.25 
 
 
274 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  30.61 
 
 
221 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28602  predicted protein  24.87 
 
 
517 aa  62.4  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.478127  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  41.79 
 
 
193 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47021  predicted protein  21.69 
 
 
509 aa  62.4  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03260  hypothetical protein  25.65 
 
 
308 aa  61.6  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.119353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  25.74 
 
 
277 aa  60.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10115  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13970)  23.51 
 
 
663 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28601  predicted protein  23.43 
 
 
479 aa  57.4  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254754  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  28.17 
 
 
369 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47685  predicted protein  23.68 
 
 
521 aa  53.5  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.773754 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03850  expressed protein  24.39 
 
 
869 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
408 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
426 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  23.05 
 
 
552 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.59 
 
 
455 aa  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.59 
 
 
386 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
439 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.57 
 
 
416 aa  44.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  29.22 
 
 
455 aa  44.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>