18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0927 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  46.29 
 
 		 1444 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  42.73 
 
 		 369 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  41.35 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  34.68 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  34.13 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  36.71 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  34.91 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  34.94 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  32.91 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  34.66 
 
 		 221 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  26.96 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  30.93 
 
 		 193 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  32.51 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  34.78 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  35.17 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  32.14 
 
 		 1057 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  29.93 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>