19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0363 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  91.61 
 
 
274 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  90.51 
 
 
274 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  43.69 
 
 
273 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  46.04 
 
 
270 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  38.54 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  38.24 
 
 
221 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  31.64 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  34.88 
 
 
193 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  34.66 
 
 
1444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  36.71 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  35 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  39.47 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  34.78 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  29.73 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  30.25 
 
 
1057 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  26.67 
 
 
552 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>