19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1943 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  41.03 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  36.65 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  38.61 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  34.78 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  33.76 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  33.1 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  35.92 
 
 		 1057 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  25.41 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1444 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  33.61 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  29.5 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  28.66 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  31.34 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  29.25 
 
 		 552 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>