20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0331 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  97.45 
 
 
274 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  90.51 
 
 
274 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  45.05 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  44.59 
 
 
270 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  38.28 
 
 
221 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  39.71 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  34.9 
 
 
277 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  36.59 
 
 
193 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  32.75 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  34.91 
 
 
297 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  36.31 
 
 
1444 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  34.94 
 
 
369 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  36.65 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  35.04 
 
 
209 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  31.47 
 
 
1057 aa  72.8  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  30.05 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  26.6 
 
 
552 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  31.67 
 
 
246 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.97 
 
 
595 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.043835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>