14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6317 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1148    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  27.84 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  28.75 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  25.45 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  27.13 
 
 		 274 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  26.67 
 
 		 274 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  23.05 
 
 		 1057 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  25.97 
 
 		 209 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  25.36 
 
 		 277 aa  47  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  28.28 
 
 		 252 aa  47  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1444 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>