20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2576 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  45.25 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  34.1 
 
 
273 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  39.79 
 
 
270 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  36.71 
 
 
221 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  43.21 
 
 
193 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  35.94 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  35.94 
 
 
274 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  31.64 
 
 
274 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  26.57 
 
 
1444 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  27.45 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  26.17 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  35.43 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  25.97 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  32.35 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  25.74 
 
 
1057 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  25.36 
 
 
552 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3546  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  25.81 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>