19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1756 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1444 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  41.35 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  41.99 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  40.74 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  42.95 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  32.42 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  32.75 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  35 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  38.46 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  32.34 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  25.7 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  32.39 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  33.76 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  27.9 
 
 		 1057 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  27.85 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.81 
 
 		 595 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  28.28 
 
 		 552 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>