19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7243 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  544  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  85.4 
 
 
273 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  45.07 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  44.59 
 
 
274 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  44.59 
 
 
274 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  46.04 
 
 
274 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  38.74 
 
 
277 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  40.8 
 
 
221 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  40.74 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  35.48 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  34.68 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  34.71 
 
 
1444 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  31.72 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  38.61 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  36.84 
 
 
209 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  35.88 
 
 
1057 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  33.82 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  28.75 
 
 
552 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3304  hypothetical protein  28.79 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>