19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6041 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6041  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7243  hypothetical protein  85.4 
 
 
270 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0331  hypothetical protein  45.05 
 
 
274 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2494  hypothetical protein  46.67 
 
 
221 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0287  hypothetical protein  45.05 
 
 
274 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0363  hypothetical protein  43.69 
 
 
274 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2576  hypothetical protein  33.86 
 
 
277 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.72365e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6897  hypothetical protein  44.57 
 
 
221 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16721  hypothetical protein  36.13 
 
 
193 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1756  hypothetical protein  42.95 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0474826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2762  hypothetical protein  42.86 
 
 
369 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.34 
 
 
1444 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0927  hypothetical protein  34.13 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1943  hypothetical protein  41.03 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0650141  decreased coverage  0.00812028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3121  O-methyltransferase  38.28 
 
 
209 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33116  predicted protein  34.97 
 
 
1057 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1168  hypothetical protein  31.34 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6317  hypothetical protein  28.57 
 
 
552 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89244  predicted protein  30 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.253398  normal  0.0648708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>