More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50723 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  100 
 
 
403 aa  838    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 
333 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 
336 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.95 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  59.19 
 
 
327 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.24 
 
 
333 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.24 
 
 
333 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.02 
 
 
333 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
333 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
333 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.63 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  60.92 
 
 
340 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 
332 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.82 
 
 
356 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 
332 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 
333 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.24 
 
 
333 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 
336 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 
331 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.46 
 
 
327 aa  378  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28845  predicted protein  59.25 
 
 
386 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  57.86 
 
 
321 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.37 
 
 
338 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 
328 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 
328 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.37 
 
 
322 aa  364  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.79 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 
334 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.66 
 
 
329 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 
334 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.16 
 
 
352 aa  360  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.97 
 
 
325 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.17 
 
 
328 aa  360  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.63 
 
 
335 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.66 
 
 
330 aa  359  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  54.94 
 
 
338 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.66 
 
 
363 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 
335 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 
335 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.66 
 
 
337 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
320 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.89 
 
 
324 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.4 
 
 
326 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
334 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 
335 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
338 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 
336 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.09 
 
 
378 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
338 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
329 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
350 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
352 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.13 
 
 
338 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.63 
 
 
328 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.14 
 
 
328 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.87 
 
 
333 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 
329 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
336 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 
340 aa  351  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 
329 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
340 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
340 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
340 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 
331 aa  350  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
329 aa  349  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
350 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.63 
 
 
336 aa  349  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 
330 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
340 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 
326 aa  348  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
329 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.74 
 
 
326 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
326 aa  347  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  57.43 
 
 
324 aa  347  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 
336 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 
325 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.11 
 
 
355 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
329 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
352 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
333 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 
338 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.01 
 
 
347 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0169  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 
348 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
329 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
350 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 
360 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 
352 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.75 
 
 
351 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
362 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
341 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.97 
 
 
337 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>