30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45703 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  100 
 
 		 2426 aa  5061    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  37.36 
 
 		 1603 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  36.07 
 
 		 1056 aa  365  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24443  predicted protein  32.78 
 
 		 1100 aa  255  7e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00582257  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  37.8 
 
 		 859 aa  72.8  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44399  predicted protein  31.93 
 
 		 1386 aa  69.3  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73625  predicted protein  37.23 
 
 		 636 aa  65.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171811  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  36.84 
 
 		 808 aa  65.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0109917 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87629  predicted protein  33.63 
 
 		 610 aa  64.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 		 1711 aa  63.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  35.62 
 
 		 904 aa  62.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 634 aa  61.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13787  predicted protein  35.78 
 
 		 190 aa  60.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166601  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47334  predicted protein  28.95 
 
 		 350 aa  58.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44609  predicted protein  36.49 
 
 		 1541 aa  56.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  40.58 
 
 		 83 aa  55.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  35.11 
 
 		 812 aa  55.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  46.81 
 
 		 1064 aa  52.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  43.55 
 
 		 455 aa  52  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30140  predicted protein  38.1 
 
 		 128 aa  51.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03448  component of the RSC chromatin remodeling complex (Eurofung)  35.56 
 
 		 884 aa  51.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  33.33 
 
 		 1255 aa  50.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14725  predicted protein  27.21 
 
 		 627 aa  49.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  29.73 
 
 		 82 aa  48.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06400  chromatin remodeling-related protein, putative  35.38 
 
 		 678 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  35.59 
 
 		 1566 aa  48.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  34.72 
 
 		 995 aa  47.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  31.58 
 
 		 1422 aa  47.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  29.55 
 
 		 1275 aa  47.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04894  transcriptional activator spt7 (AFU_orthologue; AFUA_3G11000)  41.3 
 
 		 1100 aa  47  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000259105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>